ヤマトの最初の航海に最年少クルーとして乗艦。そこで出会った星名透と結ばれて五年が経過した。 デザリアムの進駐が始まる中、夫と共に司令本部を脱出し現在は新都に潜伏。地球社会が侵略者を受け入れ順応して行く現実に言いようのない恐怖を感じる一方で、そこに楔を打ち込もうとする夫の心も理解しきれず焦燥と孤独を募らせている。 そんな中、百合亜はかつての戦友・加藤真琴に接触。夫と共に、反抗作戦への協力を呼びかけるのだが……。