「ボラーとの紛争に介入することはご法度だが、誰しも自分の身を守る権利はある」
かつては沖田十三の座乗艦〈キリシマ〉の艦長であり、ガトランティス戦役では艦隊総司令まで務めた重鎮。古代進に代わりヤマトの第四代艦長となって時空結節点への航海の指揮を執る。
頻出する様々な“謎”への洞察力、ガルマン星の危機を見過ごしにしない決断力、自ら解任した古代を信頼し、その立場を徐々に引き上げて行く調整力。持てる“力”を全て発揮し、全方位への目配せを怠らない。そんな山南の指揮があればこそ、ヤマトは迷宮を彷徨うことなく目的へ肉薄して行けるのだ。