時に西暦2207年。あのガミラス本星とイスカンダル星が消滅した事件から二年――。
突如、太陽系に謎の巨大物体〈グランドリバース〉が出現した。
地球防衛軍の善戦虚しく、幾重もの防衛網を易々と突破した〈グランドリバース〉は、
悠然と地球の新首都へと降下したのである。
音も無く出現する降下兵の群れ。上陸する多脚戦車。瞬く間に首都は制圧されてゆく。
もはや地球には抗う術はないのか――。
そのとき旧ヤマト艦隊クルーに極秘指令が下った。
「ヤマトへ集結せよ!!」
そこに聞こえてくる謎の歌声。「帰ってきた」と呟く謎の男。
果たして侵略者の驚くべき正体とは!?
人類の命運を賭けて、いま未踏の時空へと宇宙戦艦ヤマトの航海が始まる。
時に西暦2207年。あのガミラス本星とイスカンダル星が消滅した事件から二年――。
突如、太陽系に謎の巨大物体〈グランドリバース〉が出現した。
地球防衛軍の善戦虚しく、幾重もの防衛網を易々と突破した〈グランドリバース〉は、悠然と地球の新首都へと降下したのである。
音も無く出現する降下兵の群れ。上陸する多脚戦車。瞬く間に首都は制圧されてゆく。もはや地球には抗う術はないのか――。
そのとき旧ヤマト艦隊クルーに極秘指令が下った。
「ヤマトへ集結せよ!!」
そこに聞こえてくる謎の歌声。「帰ってきた」と呟く謎の男。果たして侵略者の驚くべき正体とは!?
人類の命運を賭けて、いま未踏の時空へと宇宙戦艦ヤマトの航海が始まる。
第一章 黒の侵略 あらすじ
第一話
「秘密作戦発動！ 新ヤマトへ向かえ!!」
時に西暦2207年。突如太陽系に侵入した巨大物体〈グランドリバース〉が、幾重もの防衛網を突破し地球・新首都へと降下を果たした。未曾有の事態に、古代進を始めとする旧ヤマト艦隊クルーに密かに指令が下る。「ヤマトに集結せよ!!」果たしてその言葉の意味とは――!?
第二話
「静かなる侵略・銀河よ武器をとれ！」
それは2年前にヤマトが遭遇した敵・デザリアムによる地球侵攻だった。彼らに内通する一派により、地球防衛軍司令部は無力化されてゆく。無数の降下兵により戦渦に包まれる新首都で、からくも再会を果たした古代と雪。しかし愛するふたりには悲劇が待ち構えていた……。
第二章 赤日の出撃 あらすじ
第三話
「衝撃！ デザリアム暗黒の千年史」
新都での戦闘は終結した。戦いの傷跡が残る都市を見下ろすようにそびえるグランドリバースで、デザリアムの聖総統スカルダートは、彼らの千年に及ぶ歴史を語り始める。彼らの正体とは!?
第四話
「号砲一発！！ 新・宇宙戦艦ヤマト始動」
地球圏を脱したアスカは、イカルス天文台へ辿り着いた。そこには新生・宇宙戦艦ヤマト、そしてイスカンダル王族の忘れ形見――雪を失った古代進にとって唯一の家族サーシャが待っていた。
第五話
「激突！透明戦艦を叩け!!」
デザリアムに同調する者と反発する者、さまざまな思惑のなか彼らの地球入植が開始された。一方、第11護衛隊の捜索にあたるヤマトを戦艦グロデーズが急襲する。透明な敵を相手にどう戦うのか!?
第六話
「アルフォン潜入！サーシャを取り戻せ!!」
雪を失い精彩を欠く古代は艦長職を解任。そんなおり再びグロデーズがヤマトに陽動を仕掛け、デザリアムの情報部将校アルフォンが乗り込んでくる。目的は［イスカンダルの欠片］だった――!!
第三章 群青のアステロイド あらすじ
第七話
「魔のオルフェ宙域・ヤマト、奇襲に賭けろ！」
デザリアム本星を目指すヤマトはオルフェ宙域へと進入した。グロデーズ率いる艦隊が奇襲するが、それこそ山南艦長の狙いだった。新装備・全天球レーダー室を以て、ヤマトが逆襲に転じる！！
第八話
「宇宙戦艦アリゾナ始動！デザリアムの正体を暴け！！」
地球に残されたパルチザンの手により、デザリアムに対する大規模な反抗作戦が実行される。目標は南部の父が主催する政財界のパーティ。作戦の要となるのは、ドックに眠る新造戦艦アリゾナ！！
第九話
「引き裂かれた友情！ヤマト、決死の亜空間突破！！」
デザリアムの策略により、地球で高まるガミラス排斥の動き。両国の緊張が高まるなか、ヤマトはガルマン・ガミラスの領域に繋がる亜空間ゲートに到達した。ガルマン星系でヤマトを待つものは！？
第十話
「デウスーラⅢ猛攻！脅威のアステロイド作戦！！」
デウスーラⅢとの戦闘を余儀なくされてしまったヤマト。戦いを避けようとするヤマトに、デウスーラⅢの猛攻が迫る。土門はヤマトを古代に託し、揚羽と共にコスモハウンドを出撃させる――。
第四章 水色の乙女 あらすじ
第十一話
「サーシャ・時を超えた再会」
バース星のラ＝ジェンドラ艦隊が迫るガルマン星で、古代は自分を「おじさま」と慕う17歳の少女と出会う。サーシャ──彼女こそ、デザリアムの歴史との「時の環」を繋ぐため欠かせぬ存在だった！！
第十二話
「フルールの休日」
地球ではフルールが、北海道で翼の家族との交流を通して“生きること”の意味に触れていく。一方、罪悪感から本星への旅に固執するサーシャは、焦るあまり周囲と衝突してしまう。
第十三話
「全艦隊出動！ 惑星破壊ミサイルを撃滅せよ！！」
雪が招かれた親善パーティー。様々な思惑が錯綜するなか、マザー・デザリアムの計画が静かに進行する。そのころ、ガルマン星に向けて、恐るべき惑星破壊ミサイルが放たれようとしていた──。
第十四話
「暗黒ガス雲突入！ ウラリアの魔女を追え！！」
波動機関すら凍らせる謎の寒冷化現象──周囲の星系を蝕む「ウラリアの魔女」。ヤマトを含む調査艦隊は「魔女」が棲むとされる黒色ガス雲の奥底で、巨大なデザリアムの中間補給基地と遭遇する！！
第五章 白熱の銀河大戦 あらすじ
この宇宙を凍えさせるもの──
「ウラリアの魔女」との対決の刻が迫る。
“魔女”の正体──暗黒の宇宙に潜む中間補給基地ディガブラス。
デザリアムと「ウラリアの魔女」との関係とはなにか？
“冷えた宇宙”という絶対的劣勢のなか、波動砲すら無効化する巨大要塞に、
ヤマトとガルマン・ガミラスの連合艦隊は苦戦を強いられる。
そのさなか、再び古代の前に姿を現すアルフォン。
雪という縁に導かれながらも、異なる未来を信じ、相容れぬふたりが目撃する、ディガブラスの真実とは──！？
一方、マザー・デザリアムの術中に陥った地球では、人々が自らの意思で“デザリアム化”を受け入れつつある。
もはや、一刻の猶予もない。
すべての謎の答えを求めて──
未知なる空間に飛び込んだヤマトを、衝撃の結末が待ち受ける！！
